ДНК-штрихкодирование видов животных и растений - способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия

B. С. Шнеер

Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН
197376 Санкт-Петербург, ул. проф. Попова, 2
e-mail: Shneyer@VS11044.spb.edu
Поступила в редакцию 21.11.2007 г.

ДНК-штрихкодирование было недавно предложено как метод видовой идентификации эукариот с помощью последовательности стандартного короткого фрагмента ДНК. Современные технологии позволяют секвенировать последовательность, выделив ДНК из крошечного фрагмента любой ткани организма на любой стадии онтогенеза, часто не повреждая его. В качестве стандартного участка для большинства групп животных была предложена вариабельная 5'-половина митохондриального гена COl, для грибов и растений участок еще не выбран. Программа "Штрихкод жизни" предполагает создание библиотеки штрихкодов для всех видов на Земле, что позволит осуществлять отнесение особей к известным видам и обнаружение новых и криптических видов или, по крайней мере, их предварительное распознавание. Это имеет большое значение для описания мирового биоразнообразия, особенно в случае малоизученных таксономических групп и сред обитания. Программа предполагает также создание новой специальной электронной базы данных со строгими правилами для вводимой таксономической информации об образце и месте его хранения и стандартами секвенирования и ввода в базу последовательностей. В обзоре также рассмотрены критические замечания оппонентов ДНК-штрихкодирования, ограничения и факторы, которые нужно учитывать, области практического применения. Многочисленные работы, выполненные в последние годы на разных группах животных, подтвердили возможность и перспективность ДНК-штрихкодирования. Однако его эффективность зависит от наличия полной и точной референтной базы с учетом внутривидовой индивидуальной и географической изменчивости, поэтому оно может быть более успешным в сочетании с разносторонним таксономическим анализом изучаемых групп.

Полный текст статьи доступен на сайте Elibrary.ru (необходимо зарегистрироваться).