На пути к объяснению гомохиральности жизни: поляризованные электроны инициируют хирально-селективные реакции в газовой фазе

Рис. 1. Все жизненно важные молекулы, как, например, ДНК и белки, построены из молекул строго определенной пространственной ориентации

Рис. 1. Все жизненно важные молекулы, как, например, ДНК и белки, построены из молекул строго определенной пространственной ориентации. Зеркально отраженные молекулы, хотя они и возможны физически, жизнь не использует. Происхождение этой характеристики всего живого — один из нерешенных вопросов фундаментальной биологии. Рисунок из статьи M. McKee, 2014. Electron Handedness Affects Gas Molecule Breakup

Хотя биологические молекулы могут существовать в виде двух зеркально симметричных конфигураций, жизнь использует только одну из этих возможностей. Происхождение этой гомохиральности всего живого неизвестно. Среди возможных объяснений особенно будоражит воображение гипотеза Вестера–Ульбрихта, согласно которой гомохиральность жизни является следствием пространственной несимметричности слабого взаимодействия элементарных частиц. Чисто теоретически такая связь возможна, но как именно она работает и достаточно ли она эффективна для реальных молекул в соответствующих условиях — вопросы исключительно спорные. Экспериментальные результаты, опубликованные недавно в журнале Physical Review Letters, доказывают реальность по крайней мере одного важного элемента этой гипотезы: медленные поляризованные электроны действительно способны инициировать хирально-селективные химические реакции в газовой фазе.

Гомохиральность биологических молекул и поиск ее объяснения

Практически все биологически важные молекулы хиральны. Они могут существовать в виде двух энантиомеров — пространственных конфигураций, отличающихся друг от друга зеркальным отражением и не переводимых друг в друга никаким поворотом. Казалось бы, с точки зрения химии энантиомеры совершенно равноправны — и энергии этих молекул должны быть одинаковыми, и химические реакции с их участием должны идти с одинаковой скоростью, если, конечно, все остальные молекулы тоже зеркально отражены. И действительно, в реакциях синтеза несимметричных молекул из симметричных энантиомеры возникают в виде рацемической смеси, то есть в ней поровну и тех, и других. Однако белки и нуклеиновые кислоты построены исключительно из молекул строго определенной хиральности. Как возникла такая гомохиральность, то есть хиральная «чистота», всего живого?

Этот вопрос надо разделить на два. Первый: какие молекулярные механизмы превращают небольшое первоначальное преобладание одного энантиомера над другим в полное доминирование? И второй: какова исходная причина, отдавшая одному энантиомеру предпочтение над другим?

Первый вопрос, конечно, сложен, но по крайней мере понятно, как он в принципе решается. Если молекулы участвуют в автокаталитической реакции, то есть как бы «размножаются» на подходящем субстрате под действием внешних условий, то небольшой начальный дисбаланс может усиливаться с течением времени. В какой-то момент один энантиомер будет настолько преобладать над другим, что полностью подавит его катализ и вытеснит его из смеси. Разумеется, для получения удовлетворительного ответа надо продемонстрировать, что такие реакции действительно эффективно идут в тех условиях, которые существовали за Земле или в космосе до зарождения жизни. Текущее состояние этого вопроса см. в недавнем обзоре The Origin of Biological Homochirality.

А вот второй вопрос будоражит воображение куда сильнее, поскольку тут возникают намеки на поразительную связь между свойствами элементарных частиц и жизнью.

Здесь есть несколько основных возможностей. Можно попробовать списать изначальный дисбаланс на чистую случайность, ведь левых и правых молекул не бывает строго одинаковое число. Однако совершенно неясно, достаточно этих случайных флуктуаций концентрации для того, чтобы запустить механизм усиления. Кроме того, в разных местах смеси дисбаланс будет то в одну, то в другую сторону, и на больших масштабах эти флуктуации будут нивелироваться. Гораздо убедительнее звучит предположение, что существует некоторый физический механизм, реально предпочитающий левые или правые молекулы, и благодаря этому медленно, но неуклонно направляющий эволюцию рацемической смеси. И вот тут становятся совсем интересно.

Среди фундаментальных физических законов лишь один способен различать левое и правое — это слабое взаимодействие элементарных частиц. Слабое взаимодействие является источником короткодействующих сил между ядром и электронами, а также отвечает за бета-распад и другие превращения элементарных частиц и ядер. С 1957 года известно, что, в отличие от всех остальных фундаментальных взаимодействий, слабое нарушает пространственную симметрию. «Левое» и «правое» для слабого взаимодействия — различаются.

Одно из следствий этого — небольшая разница в уровнях энергии между левыми и правыми молекулами. Эта разница вычисляется, но оказывается настолько малой, что трудно представить себе, как она могла бы привести к сколько-нибудь существенному эффекту. Подробный разбор этой ситуации см. в нашей задаче Слабое взаимодействие и хиральность биологических молекул

Другой вариант возможного воздействия такой. Под действием космических лучей в атмосфере появляются нестабильные изотопы, которые распадаются за счет слабого взаимодействия и испускают электрон. Этот электрон преимущественно левополяризованный — тут как раз и проявляется специфика слабого взаимодействия. Эти электроны могут по-разному воздействовать на левые и правые молекулы в рацемической смеси, преимущественно разрушая один энантиомер либо, наоборот, способствуя его усиленному синтезу. Эффект может быть совсем небольшим, но, поскольку он действует постоянно и в течение очень долгого времени, он может привести к нужному исходному дисбалансу — а уж затем эстафету подхватит автокаталитическая реакция.

Эта гипотеза о прямой причинной связи между свойствами слабого взаимодействия и гомохиральностью жизни была впервые высказана в 1959 году, практически сразу же после экспериментального обнаружения несохранения пространственной четности в слабых взаимодействиях; она с тех пор называется гипотезой Вестера–Ульбрихта. Разумеется, для серьезного вывода одних лишь слов недостаточно. Всё-таки поляризация электрона — это его внутреннее свойство, и совершенно неочевидно, что поляризованный электрон может по-разному взаимодействовать с двумя энантиомерами хиральных молекул. Поэтому для того, чтобы эта гипотеза обрела серьезный вес, требуется экспериментально убедиться, что (1) поляризованные электроны действительно могут селективно разрушать или способствовать синтезу определенных энантиомеров, что (2) этот механизм работает для биологически важных молекул, и что (3) он реально мог быть эффективным в соответствующих условиях.

И вот здесь поиск доказательств сталкивается с большими трудностями. Первые экспериментальные работы 60-х годов показывали нулевой эффект. В последующие десятилетия появились первые положительные данные, которые, впрочем, оказалось трудно воспроизвести (см. обзорную статью W. A. Bonner, 2000. Parity violation and the evolution of biomolecular homochirality). Задача осложнялась тем, что непонятно было, какой механизм воздействия на молекулы следует искать. Электроны, вылетающие при бета-распаде, слишком энергетичны, чтобы напрямую — и по-разному! — вмешиваться в электронную структуру молекулы. Зато они при столкновениях могут испускать поляризованные фотоны, которые, в свою очередь, поглощаются хиральными молекулами. Поэтому значительные усилия были направлены на поиск фотоиндуцированных (вызванных светом) хирально-селективных (по-разному протекающих в левых и правых энантиомерах) реакций. Другая возможность — это когда электроны большой энергии выбивают вторичные низкоэнергетические электроны, которые уже и воздействуют на молекулы. Наконец, и сами исходные электроны могут, замедлившись от столкновений, сохранить некоторую степень своей исходной поляризации и напрямую воздействовать на молекулы. Все эти варианты активно изучались; см. недавний обзор этой области в публикации R. A. Rosenberg, 2010, Spin-Polarized Electron Induced Asymmetric Reactions in Chiral Molecules. Общий вывод такой: несмотря на отдельные результаты, никаких убедительных доказательств в пользу гипотезы Вестера–Ульбрихта пока нет.

Новый результат

На днях в журнале Physical Review Letters вышла статья, которую можно считать пусть и небольшим, но вполне конкретным шагом на пути к этому. Авторы работы сообщают о результатах эксперимента по облучению чистых энантиомеров бромкамфоры (вещества с химическим составом C10H15BrO) потоком поляризованных и очень медленных электронов — с энергией в доли электронвольта. При столкновении с молекулой электрон присоединялся к ней, образовывалось промежуточное возбужденное состояние молекулы, и спустя некоторое время она диссоциировала — от нее отваливался отрицательно заряженный ион брома. Эффективность этого процесса в зависимости от поляризации электронов и конкретного энантиомера и стала предметом исследования.

Экспериментальная установка в этой работе состоит из двух камер (рис. 2). В левую камеру входил лазерный луч (1) и выбивал в полупроводниковом фотокатоде (3) электроны, которые затем направлялись в правую камеру, где и проводился эксперимент. Электростатические замедлители позволяли настраивать кинетическую энергию электронов, долетающих до второй камеры. В ней находилась цилиндрическая капсула с бромкамфорой в газовой фазе, а ее стенки позволяли измерять электрический ток, который создавали попавшие на нее после диссоциации ионы брома. Электрический ток и являлся главной измеряемой величиной в этом эксперименте.

Рис. 2. Экспериментальная установка по измерению хирально-селективного воздействия поляризованных электронов

Рис. 2. Экспериментальная установка по измерению хирально-селективного воздействия поляризованных электронов; см. пояснения в тексте. Изображение из обсуждаемой статьи

Свойства процесса выбивания и отсеивания электронов таковы, что циркулярно поляризованный лазерный свет, чью поляризацию настраивать легко, приводил к высокой степени поляризации электронов. Типичный сеанс работы этого эксперимента выглядел так: капсулу наполняют газом с каким-то определенным чистым энантиомером, например, левым, облучают его потоком электронов, и регистрируют электрический ток на её стенках. В ходе измерения поляризацию электронов быстро переключают с левой на правую и обратно с частотой 210 раз в секунду. Измеряемый электрический ток при таком переключении тоже становится то чуть-чуть больше, то меньше, с той же частотой. Это относительное колебание тока измеряют и обозначают aL, поскольку оно относится к левому энантиомеру.

Затем повторяют такую же серию измерений, но только с газом из правых энантиомеров. Полученная амплитуда колебаний тока обозначается aR. По идее, она должна быть противоположного знака, чем aL, но из-за разнообразных погрешностей это соотношение может нарушаться. Чтобы погрешности подавить, экспериментаторы вычисляют окончательную асимметрию: A = aL − aR. Ненулевое значение этой асимметрии как раз и означает, что электроны определенной поляризации сильнее разрушают один энантиомер, чем другой.

На рис. 3 показаны результаты эксперимента. Вверху — типичная величина тока на стенках капсулы; в идеальном случае она должна один-в-один соответствовать интенсивности реакции диссоциации молекул при присоединении электрона. Внизу черными квадратами показан главный результат измерения — величина асимметрии A в зависимости от замедляющего потенциала. При подходящей энергии она заметно отлична от нуля и достигает значения 0,04%. Это является прямым подтверждением того факта, что медленные поляризованные электроны действительно слегка по-разному взаимодействуют с левыми и правыми энантиомерами.

Рис. 3. Данные эксперимента

Рис. 3. Вверху: электрический ток, регистрируемый на стенках камеры при разных значениях замедляющего электрического потенциала. Внизу: асимметрия A при разных вариантах эксперимента. Черные квадратики и красные кружочки отвечают двум вариантам оптической системы с противоположной поляризацией лазерного света. Синие треугольники показывают результат контрольного эксперимента с рацемической смесью бромкамфоры. Изображение из обсуждаемой статьи

Красными цветом на том же графике показаны результаты контрольного эксперимента, в котором поляризующую лазерный свет пластинку изменили на обратную и вновь повторили всю серию измерений. Как видно, результат вполне согласуется с обращенными данными основного эксперимента. Наконец, для пущего контроля авторы работы взяли рацемическую смесь бромкамфоры, в которой поровну тех и других молекул, и снова проделали весь эксперимент. Асимметрия получилась нулевая (синие треугольники), что и следовало ожидать.

Разумеется, в таком эксперименте всегда есть источники фонов и погрешностей. Самый очевидный — ток на стенках камеры мог возникнуть не только из-за ионов брома, но из-за электронов, например, когда они рассеивались на аппаратуре на входе в камеру. Этот фон можно подавить магнитным полем, которое выводило бы электроны из камеры, но не мешало бы тяжелым ионам брома долетать до стенок, но полностью устранить его все равно не получилось. Авторы статьи приводят результаты многочисленных проверок того, можно ли списать полученные данные на этот фон, и приходят к выводу, что нет. Таким образом, перед нами измерение реального процесса в хиральных молекулах, индуцированного медленными электронами.

Конечно, описанные результаты ни в коей мере не претендуют на железное доказательство того, что гипотеза Вестера–Ульбрихта действительно верна. Однако здесь был сделан вполне конкретный шаг на пути к возможному доказательству. В четко контролируемых условиях, в газовой фазе, была зарегистрирована хирально-селективная химическая реакция, вызванная поляризованными электронами. То, что реакция шла в газовой фазе, а не на твердой подложке, как в статье R. A. Rosenberg et al., 2008, Chiral-Selective Chemistry Induced by Spin-Polarized Secondary Electrons from a Magnetic Substrate, очень важно. При облучении твердой подложки накладываются друг на друга разные эффекты: первичный электрон, вторичные электроны, поляризованные фотоны, эффекты конденсированного вещества. Но здесь, при столкновении электрона с одной молекулой работает единственный механизм — первичный. Этот механизм теперь могут обсчитать теоретики, сравнить с данными, настроить теоретическое описание и дальше предсказывать на его основании аналогичные процессы с настоящими биологически важными молекулами. Туман неопределенности постепенно развеивается, и, видимо, вскоре мы сможем уже наблюдать количественное описание реакций этого класса.

Источник:
J. M. Dreiling and T. J. Gay. Chirally Sensitive Electron-Induced Molecular Breakup and the Vester-Ulbricht Hypothesis // Phys. Rev. Lett. 113, 118103 (2014).

Игорь Иванов


40
Показать комментарии (40)
Свернуть комментарии (40)

  • anthropomorphous  | 15.09.2014 | 19:48 Ответить
    Ужаснулся, когда увидел заголовок :о))
    Но статья вполне доходчиво объяснила что к чему. Спасибо, очень интересно.

    А если по теме, то очень печально всё для лириков разворачивается в связи с последними открытиями в возникновении и эволюции жизни. Оказывается мы всего лишь мешки, набитые белкАми разной сложности :о(
    Ответить
    • alxt > anthropomorphous | 16.09.2014 | 09:55 Ответить
      > Оказывается мы всего лишь мешки, набитые белкАми разной сложности :о(

      Не путайте науку и философию (религию). Бессмысленны как попытки лезть в науку философам (креационизм) так и обратные ("мешки"). Даже католики признали происхождение человека от обезьяны и это не мешает им верить :)

      А статья интересная. И интересна в т.ч. демонстрацией научного подхода во всей красе.
      Ответить
  • olegov  | 15.09.2014 | 20:15 Ответить
    Да учитывая теории абиогенеза первые молекулы должны были образовываться по действием фотокатализа в газовой фазе, и вполне логично что селективное образование определенных энантиомеров сразу снимает проблему утилизации не использованных при абиогенезе. Как всегда природа легко и изящно убивает сразу двух зайцев. Хотя конечно возможности минералов в селекции образования нужных изомеров тоже велики.
    Ответить
  • nicolaus  | 15.09.2014 | 21:15 Ответить
    «А вот второй вопрос будоражит воображение куда сильнее, поскольку тут возникают намеки на поразительную связь между свойствами элементарных частиц и жизнью.»

    Похоже, что это продолжение дискуссии, начало которой было с поста от 25.09.2013 20:42 вот здесь http://elementy.ru/news?discuss=432089 : «Существует пирамида. Наверху пирамиды элементарные частицы с простыми с виду внешними свойствами. Разнообразие частиц, скорее всего, конечно и возможно все частицы нашего мира уже открыты. Количество частиц, из которых состоит видимый окружающий нас мир, совсем небольшое. Внизу пирамиды практически бесконечное разнообразие физических и биологических систем невероятной сложности. Встает вопрос, возможно ли неуклонное расширение основания пирамиды и усложнение материи на основе простых свойств элементарных частиц материи? Ответ на этот вопрос – скорее всего, нет. Из ничего нечего не бывает.»

    «Одно из следствий этого — небольшая разница в уровнях энергии между левыми и правыми молекулами. Эта разница вычисляется, но оказывается настолько малой, что трудно представить себе, как она могла бы привести к сколько-нибудь существенному эффекту. Подробный разбор этой ситуации см. в нашей задаче Слабое взаимодействие и хиральность биологических молекул»

    Вблизи фазового перехода – замерзания воды или таяния льда система находится в крайне неустойчивом состоянии. При этом проявляются несущественные энергетические уровни (которые обычно скрыты ввиду преобладания тепловой энергии, когда вода нагревается, или в случае преобладания энергии связей между молекулами, когда вода превратилась в лед). Как оказалось, левые и правые молекулы легко разделяются путем циклического замораживания и размораживания. «Сотруднице Лондонского имперского колледжа Д.Блэкмонд удалось разделить смесь правых и левых химических соединений, в том числе и аминокислот, подвергая ее последовательным циклам замораживания и нагревания. Подобная простота воздействия буквально поразила ученых, которые ранее пытались объяснить хиральность аминокислот и сахаров в нуклеиновых кислотах чуть ли не воздействием вселенского «разума». http://www.ng.ru/science/2010-04-28/11_molecula.html
    Ответить
  • PavelS  | 15.09.2014 | 23:46 Ответить
    Мне доводилось слышать, что получилось создать жизнь из неорганического вещества (синтезировать все ингридиенты, собрать). Было бы интересно, возможно ли синтезировать жизнь с противоположной хиральностью и изучать её? Никто не брался за такую задачу? Ведь просто повторение того, что сделано природой - это красивая заметка в прессе, но не даёт выхода научного продукта, а другое дело - что-то чего никогда не было, и что живое.
    Ответить
    • anthropomorphous > PavelS | 16.09.2014 | 09:18 Ответить
      А зачем это делать? Насколько я понимаю, жизнь с противоположной хиральностью ничем принципиальным не будет отличаться от нашей. Правые молекулы точно так же вступают в реакции как и левые.
      Ответить
      • PavelS > anthropomorphous | 16.09.2014 | 13:23 Ответить
        Зачем делать? Чтобы экспериментально подтвердить или опровергнуть теоретические посылки. Ведь реакций много, может выясниться что какая-то редкая реакция в зеркальной форме не идёт. Вообще не идёт, или идёт в 10 раз медленней. И это будет прорыв в науке с ответом на кучу вопросов. Также актуален вопрос, как будут ко-эволюционировать в пробирке 2 зеркально-отличающихся вида микробов.

        Также я допускаю что зеркальная жизнь возможно будет в чём-то экологически и технологически значима, т.к. зеркальные трансгены не смогут вести горизонтальный генетический обмен с природой - меньше риск загрязнений природы промышленными трансгенами. А это уже снятие ряда ограничений на биотехнологии, на очистку сточных вод, добычу ископаемых трансгенными бактериями и т.п. Также возможно будет получен дешевый способ синтеза чего-то там чего раньше не получалось... это опять же технологии.

        Ну и наконец, у меня есть доля сомнений что уже проделанный синтез жизни из неживого был проделан "честно", т.е. что не было взято больших фрагментов живой клетки. А если делать "зеркало", то придётся делать всё.
        Ответить
    • niki > PavelS | 16.09.2014 | 11:01 Ответить
      Рано еще за такие задачи браться.
      Ответить
      • PavelS > niki | 16.09.2014 | 13:23 Ответить
        Почему рано? По мне так технологии (якобы) готовы.
        Ответить
        • niki > PavelS | 16.09.2014 | 13:54 Ответить
          Так якобы или готовы. Как вы себе это представляете?
          Ответить
          • PavelS > niki | 16.09.2014 | 20:02 Ответить
            1. Не отвечайте вопросом на вопрос. Я спросил почему рано. Вы оставили это без ответа. Я полагаю что вы считаете "ученым слабО", но я не люблю домысливать за других людей то, что они сами могли бы и написать.
            2. Тут проскакивала статья, что ученым удалось собрать живую клетку из неживых молекул. Может, путаю. Т.е. было всё синтезировано, включая ДНК. Т.е. вроде как было заявлено, что ученые освоили технологии для создания жизни "из первых принципов". Если это правда и тут нет мошенничества и подмены понятий типа того что ученые просто проигнорировали какие-то сложности, "украв" у природы готовые детали, то то же самое можно повторить и с зеркальными молекулами.
            3. ССылка http://elementy.ru/blogs/users/voix/44678/
            Ответить
            • Teodor > PavelS | 17.09.2014 | 13:02 Ответить
              В указанной статье ученые собрали по кускам "новую" ДНК. Затем по этой ДНК живая клетка создала новую клетку. Её громко назвали искусственной.
              Клетка не искусственная, и даже ДНК не искусственная, так как они к готовой ДНК подсаживали куски. Естественно, процедура исключает смену хиральности.
              Ответить
  • niki  | 16.09.2014 | 11:00 Ответить
    Выросли два хиральных кристалла.
    Один скатился мимо, другой попал в лужу.
    Жизнь его съела и ей похорошело.
    Ответить
    • a_b > niki | 16.09.2014 | 11:17 Ответить
      с десяток тех молекул
      лежали две недели
      одна из них распалась
      и их осталось девять
      Ответить
  • Teodor  | 16.09.2014 | 15:54 Ответить
    То, что поляризованные электроны несколько активнее реагируют с разной закрученности атомами - это естественно и показано в этом эксперименте. Ещё бы за чудо преподнесли поляризацию света при прохождении вещества из хиральных молекул.
    Но при чём здесь гипотеза Вестера-Ульбрихта? Разве описанный опыт - это эксперимент по слабому взаимодействию?
    Во-вторых, одна хиральность - следствие того, что живые организмы скрещиваются и передают хиральность потомкам на протяжении миллионов циклов. Более того, хиральность важна при питании. Неизбежно одна из симметрий была бы выдавлена, если бы центров зарождения жизни было несколько с разными хиральностями. Какая именно хиральность возобладала - дело случая.
    Какое отношение имеет описанный эксперимент к этой проблеме - непонятно.
    Ответить
    • niki > Teodor | 17.09.2014 | 23:46 Ответить
      "Во-вторых" совершенно верно.

      Ситуация совершенно естественная. Вот если бы было наоборот — имелись обе хиральности, то вот такое чудо надо было бы объяснять. Кстати, где они могли бы быть? Зайцы правые, волки левые? Или в каждом организме по два набора всего?

      В неорганике хиральные кристаллы дело обычное. В органике вообще трудно найти что-то не хиральное. Так что не понятно в чем видится загадка.
      Ответить
      • Teodor > niki | 19.09.2014 | 10:36 Ответить
        Согласен с Вами насчёт чудесности равноправности хиральности в живой природе. Левые волки не усваивали бы сложные молекулы правых зайцев. Кроме того, у них общие (и однозакрученные) предки. А вот если жизнь будет обнаружена на Марсе, то не исключено, что она будет другой хиральности. Оговорюсь: если теория панспермии или, как минимум, переноса жизни с Марса на Землю неверна.
        Два набора всего в одном организме невозможно по причине обмена веществ. И, опять же, организм это наследник одной яйцеклетки и одного сперматозоида, подходящего ей.
        Ответить
      • aa > niki | 15.07.2015 | 14:51 Ответить
        Хиральность неорганических кристаллов может быть вызвана особым расположением атомов (ионов) в элементарной решетке. Образование и рост такого кристалла не перечит законам термодинамики. Другое дело, когда касается синтеза молекул - там, вероятность синтеза правого и левого изомера строго равна, поэтому синтезированное вещество не имеет хиральности ("вызванное именно самими молекулами"). Хиральность биологических молекул - в этом и есть интерес, как из объема выделить молекулы "избранной хиральности", ведь энтропия раствора также максимальна, когда правых и левых изомеров в растворе имеется 50 на 50. И если кто либо говорит, что с помощью "размораживания - таяния" у него получилось собрать изомеры одного вида в одном объеме - есть риск, что мы имеем дело с шарлатанами от науки, ведь это - нарушение второго закона термодинамики.
        Ответить
    • nicolaus > Teodor | 18.09.2014 | 08:09 Ответить
      Согласно Вашей гипотезе было много центров зарождения жизни с разными хиральностями. При этом непонятно, как одна жизнь «выдавила» другую.
      Ответить
      • komod > nicolaus | 19.09.2014 | 02:17 Ответить
        спонтанное нарушение симметрии однако.
        типа возникновения мужского и женского пола у гемофрадитов, или переход человечества на использование правой резьбы.
        левая резьба, как и правые аминокислоты используются в исключительных случаях: http://nanodigest.ru/nauka-i-obrazovanie/nauchno-populiarnye-materialy/rol-levykh-aminokislot-v-biokhimii-zhivykh-organizmov
        Ответить
        • nicolaus > komod | 19.09.2014 | 08:53 Ответить
          Существует же левостороннее и правостороннее движение в разных странах. Что мешает существовать левосторонней и правосторонней жизни в разных лужах? Да и жить вместе в одной луже, что мешает? Мужской и женский пол ведь существуют вместе и жить друг без друга не могут.

          P.S. В отношении спонтанного нарушения симметрии в физике появились вот какие мысли. На мой взгляд, спонтанное нарушение электрослабой симметрии не совсем уж спонтанное (в смысле случайное), просто материя замерзла, и произошел фазовый переход – т.е. произошло вполне закономерное явление. Если говорить спонтанности (о случайности) в абсолютно строгом понимании, то должно быть строго два равновероятных исхода. На пример, в случае спонтанного нарушения электрослабой симметрии должен быть еще другой исход - помимо нашей должна быть еще одна симметричная нашей вселенная.
          Ответить
          • Teodor > nicolaus | 19.09.2014 | 10:49 Ответить
            Ситуация с движением - хороший пример. Автомобилям лет сто всего. Так же, при множественном зарождении жизни, существовала органика разной хиральности. Когда автодороги объединятся по-настоящему, движение на них будет унифицировано. Левостороннее движение существовало на острове Британия. Затем оно наследовалось британскими оккупированными территориями. Подобно тому, как в одной дорожной системе авто не могут одновременно ездить и по правой и по левой стороне одновременно, так же не может быть разных хиральностей в устоявшемся миллиарды лет биоценозе.
            Пример же с мужским и женским полом совершенно не в тему. Это, скорее, как левая и правая часть спирали ДНК - они дополняют друг друга.
            Нарушение электрослабой симметрии тоже не в тему вообще и даже близко не лежало. Там нарушение симметрии относительно наличия и отсутствия массы у калибровочных бозонов и фотонов соответственно.
            Ответить
            • nicolaus > Teodor | 19.09.2014 | 11:07 Ответить
              В принципе, могут быть разные дороги - правосторонняя и левосторонняя, и они могут быть на одной территории. Природа может выпускать как машины с левым рулем, так и с правым. Каждая группа машин будет ездить по своим дорогам и не будут друг другу мешать. В принципе, правая и левая жизнь могут существовать вместе и даже быть симбиозами друг другу. Что то этому мешает. Вопрос: что?

              В тему. Другая гипотеза утверждает, что хиральность живых молекул является следствием нарушения четности в нашей вселенной (собственно это является темой обсуждаемой статьи). Нарушение четности является следствием нарушения электрослабой симметрии. Если бы не было нарушения электрослабой симметрии никакого нарушения четности не было бы.

              У меня есть гипотеза, согласно которой нарушение четности связано с однобокостью нашей вселенной. Второй "бок" нашего мира находится во второй вселенной, которая, по существу, зеркальна нашей. Однобокостью нашей вселенной объясняется хиральность биологических молекул.
              Ответить
              • Teodor > nicolaus | 19.09.2014 | 11:37 Ответить
                Я вижу, Вы любите спор ради спора. Автодвижение - это лишь аналогия. Водители теоретически могут перестраиваться с одного типа движения на другой. Туннель под Ла-Маншем...
                Да и то, когда я впервые попал в Таиланд я ужасался тому, что все вылезли на встречку :)
                В природе это означало бы, что системы с разносторонним движением вымерли бы в процессе эволюции как склонные к суициду при ошибках.
                Как это происходит и с левосторонним движением - Чехословакия, Швеция.
                Ответить
                • nicolaus > Teodor | 19.09.2014 | 11:50 Ответить
                  В примере с жизнью необходимо доказать, что возможны «лобовые» столкновения и в чем они выражаются. А так, пустой разговор.

                  P.S. Вполне возможно, что в результате однобокости нашей вселенной биологическая жизнь с другой хиральностью в принципе не возможна. Это и есть объяснение.
                  Ответить
                  • Angl > nicolaus | 19.09.2014 | 13:11 Ответить
                    Это вряд ли, ведь отдельные исключения существуют.
                    http://biomolecula.ru/content/561
                    Ответить
                    • nicolaus > Angl | 19.09.2014 | 17:31 Ответить
                      Я думаю, что жизнь использует отдельные D-энантиомеры с той целью, что они добавляют новые свойства, которые, по-видимому, другим способом получить не удается. Однако это не значит, что основа живых организмов меняется. Если было бы выгодно, то весь живой организм за долгую эволюцию мог бы полностью перестроиться на D-энантиомеры (раз он может их синтезировать). Однако этого не происходит.
                      Ответить
                      • komod > nicolaus | 20.09.2014 | 00:30 Ответить
                        "Дело в том, что фрагмент полинуклеотидной цепи с «хиральным дефектом» — звеном с хиральной конфигурацией, отличающейся от конфигурации остальных звеньев в цепи, вообще не может воспроизводиться по правилу комплементарного соответствия звеньев исходной цепи и ее копии."
                        http://gordon0030.narod.ru/archive/11821/
                        и еще здесь: http://ralimurad.narod.ru/lib/gordon/assymetry/index.html

                        Нарушение зеркальной симметрии должно было возникнуть почти в самом начале, когда жизнь существовала в форме не особо сложных автокатолических реакций.
                        Ответить
                  • Teodor > nicolaus | 20.09.2014 | 11:55 Ответить
                    А почему "однобокость нашей вселенной" позволяет синтезировать в химических реакциях молекулы различной хиральности с вероятностью 50%?
                    Это как? Для живых вселенная однобока, а для неживых та же вселенная двубока? Простая логическая ошибка.
                    Не говоря о контрпродуктивности "гипотезы". Ничем не лучше объяснения "потомушта так создал бог".
                    Ответить
                    • nicolaus > Teodor | 20.09.2014 | 22:02 Ответить
                      "Это как? Для живых вселенная однобока, а для неживых та же вселенная двубока?"

                      Для неживой природы вселенная также однобокая. Скорость роста кристаллов из разных энантиомеров немного отличается http://www.pnas.org/content/96/8/4252.full (ссылка Игоря Иванова).
                      Ответить
                      • Teodor > nicolaus | 22.09.2014 | 11:17 Ответить
                        По поводу статьи по ссылке скажу, что авторы забыли, что кобальт и иридий являются переходными металлами. А гидратные комплексы переходных металлов оптически активны.
                        Вы понимаете разницу между 1 эВ (типичные энергии хим процессов) и 10^-13 эВ (влияние слабого взаимодействия)? Не может такая пренебрежимо малая разница дать сколько-нибудь заметный вклад. Если не затратить денег на эксперимент типа как на адронный коллайдер. И даже если такой эксперимент будет проведён британскими учёными, то измеренный исчезающий эффект не может объяснить вытесняющуюю почти на 100% однозакрученность "живых" молекул.
                        Ответить
                        • nicolaus > Teodor | 23.09.2014 | 08:22 Ответить
                          «По поводу статьи по ссылке скажу, что авторы забыли, что кобальт и иридий являются переходными металлами. А гидратные комплексы переходных металлов оптически активны.»

                          Я не думаю, что ученые не учли данное обстоятельство и проводили свои опыты на подоконнике.

                          «Вы понимаете разницу между 1 эВ (типичные энергии хим процессов) и 10^-13 эВ (влияние слабого взаимодействия)? Не может такая пренебрежимо малая разница дать сколько-нибудь заметный вклад.»

                          В оданной гипотезе хиральность объясняется не преимуществом каких-либо энантиомеров в исходном синтезе. Изначальная жизнь могла широко использовать как L, так и D энантиомеры (см. комментарий RomTV). «Вытеснняющая однозакручееность», скорее всего, является следствием естественного отбора. При этом будет иметь значение даже очень небольшая разница в свойствах энантиомеров.

                          Следует отметить, что влияние электромагнитных сил может быть очень точно скомпенсировано в водных растворах (например, в воде многие белковые молекулы являются строго электрически нейтральными). При этом силы слабого взаимодействия за счет незначительного изменения углов химических связей могут нарушать общую симметрию электромагнитных связей и проявлять себя в «чистом» виде. Поэтому пример с подавляющим превосходством электромагнитного взаимодействия не совсем корректен.

                          Если опыты с ростом кристаллов для вас неубедительны, то могу привести другие примеры влияния очень незначительных сил на химические, физические и биологические процессы. Например, в настоящее время утрачена возможность синтеза некоторых лекарств (например, синтеза женского гормона), ввиду того, что современные технологии не в состоянии воспроизвести незначительные примеси в растворах, которые оказались важными для синтеза нужного энантиомера с необходимой чистотой (данные приведены по памяти). Дополнительно, выше (см. 15.09.2014 21:15) я приводил ссылку о разделении раствора правых и левых молекул путем термоциклирования. Или, относительная сила электромагнитного взаимодействия в 10^36 раз больше гравитационного. Однако живые организмы, даже в водных растворах, чувствительны к невесомости и развиваются по другому.
                          Результаты этих опытов нельзя обосновать расчетами.
                          Ответить
                          • Teodor > nicolaus | 23.09.2014 | 12:09 Ответить
                            Авторы в статье указали на влияние примесей бактерий - стерилизовали и даже год выдерживали ячейки с образцами в надежде на гибель бактерий. Почему только при этом хиральность материала, допустим погибших, бактерий должна была измениться - непонятно.

                            Молекулы не могут быть строго электрически нейтральны на атомарном уровне. Все связи - это связи через формирование электронного облака. Все химические реакции, которые и являются предметом рассмотрения, имеют электромагнитную природу.

                            Если результаты опытов нельзя обосновать расчётами, то Ваш путь к храму или шаманскому бубну. При чём здесь наука?
                            Ответить
                            • nicolaus > Teodor | 23.09.2014 | 18:07 Ответить
                              Я склонен верить авторам статьи. Рассуждать о возможных ошибках в их опытах можно бесконечно. Если есть стоящая идея – напишите им письмо.

                              Некоторые белки электрически нейтральны – если опустить их в воду, они создают не кислую и не щелочную среду.

                              В отношении того, как может проявлять себя слабое взаимодействие. Возможно, оно сдвигает углы расположения электронных облаков, внося несимметрию. Расположение химических связей определяются расположением электронных облаков, поэтому никакого противоречия нет.

                              В органической химии все расчеты делаются приблизительно. Наука еще не доросла до точных расчетов. Поэтому расчетный результат просто может «потеряться». Помимо этого, для объяснения результатов опытов, которые приведены в качестве примера, еще нет теории.
                              Ответить
                            • nicolaus > Teodor | 24.09.2014 | 07:57 Ответить
                              «Вы понимаете разницу между 1 эВ (типичные энергии хим процессов) и 10^-13 эВ (влияние слабого взаимодействия)? Не может такая пренебрежимо малая разница дать сколько-нибудь заметный вклад.»

                              Наверное, те примеры, которые я написал, не совсем убедительны. Чтобы Вас не пугала большая разница между электромагнитными силами и силами слабого взаимодействия приведу наглядный пример.

                              Если взять стакан воды и вылить его на пол, то вода растечётся тоненькой лужицей. Если осторожно изъять воду из стакана в невесомости, то получится шар из воды. Наблюдается явная разница в форме воды. Далее, посчитаем силы, которые действуют между молекулами воды. Рассмотрим электромагнитные силы. При этом не будем учитывать компенсацию этих сил – посчитаем величину силы, которая определяется полным зарядом молекулы воды в случае притяжения к такому - же заряду другой молекулы (протоны притягиваются к электронам, а электроны притягиваются к протонам соседней молекулы). Эта сила получается 9,54*10^-7 Н. Далее посчитаем величину силы, с которой молекула воды притягивается к Земле.
                              Получается 2,93*10^-25 Н. Соотношение 3,25*10^18

                              Я думаю, что разницу в форме воды можно заметить при нахождении воды в невесомости и на поверхности небольшого астероида. Поэтому соотношение можно увеличить еще на 3-8 порядков. В итоге получаем соотношение 3,25*10^26 между электромагнитными силами и гравитационными силами, при котором вода меняет свою форму. Постольку гравитационные силы перевешивают, это соотношение означает степень компенсации электромагнитных сил в стакане воды.
                              Ответить
                              • Teodor > nicolaus | 25.09.2014 | 17:06 Ответить
                                Сила - векторная величина. Вы упускаете, что сила тяжести действует в одном направлении. Следовательно, надо умножать на число порядка числа Авагадро. А это 10^23.
                                А вот слабое и электромагнитное взаимодействие имеют совпадающий вектор.
                                Ответить
                                • nicolaus > Teodor | 25.09.2014 | 21:34 Ответить
                                  Здесь необходимо рассматривать столбик воды, с сечением в одну молекулу. Столбик воды высотой в 1 мм состоит приблизительно из 1,8*10^6 молекул. Поэтому учет веса столбика молекул воды вместо веса одной молекулы в качественном плане не меняет ситуацию. Для точной оценки степени компенсации электромагнитных сил в воде необходимо измерить усилие сопротивления сдвигу слоя воды, при условии практически нулевой скорости сдвига (или измерить усилие трения покоя воды.) Я думаю, что это усилие приближается к нулю. По меньшей мере, согласно Википедии https://ru.wikipedia.org/wiki/%D2%F0%E5%ED%E8%E5_%EF%EE%EA%EE%FF для жидкостей трение покоя равно нулю.

                                  «А вот слабое и электромагнитное взаимодействие имеют совпадающий вектор.»

                                  Я выдвинул предположение, что слабое взаимодействие нарушает симметрию электронных облаков. Например, тетраэдр электронных облаков углерода теряет симметрию. Это приводит, например, к изменению углов химических связей. Изменение углов химических связей в длинной молекуле, например в белке, может накапливаться. В результате «левый» белок не будет строго симметричным "правому" и будет иметь другие свойства.
                                  Ответить
              • RomTV > nicolaus | 19.09.2014 | 17:24 Ответить
                Вот в этой замечательной статье написано о том, что фосфоглицерол в липидах мембран архей и бактерий имеют разную хиральность.
                "Мембраны современных бактерий состоят из фосфолипидов — сложных эфиров глицерола, двух остатков жирной кислоты и одного фосфатного остатка. К фосфатному остатку присоединяется обычно полярная группа: этаноламин, холин, аминокислота серин или многоатомный спирт инозитол. Гидрофобные хвосты жирных кислот образуют средний слой мембраны, а полярные остатки глицерола, фосфата и вспомогательных полярных групп — наружный и внутренний слои. Мембраны архей устроены в принципе похоже, но на другой химической основе. Их липиды имеют в качестве гидрофобной части терпеновые спирты, например геранилгераниол. Их углеводородные цепочки несут метильные группы через каждые четыре атома. Эти спирты простыми эфирными связями присоединяются к глицерол-фосфату, к фосфатному остатку так же присоединены полярные головки, такие же, как у бактерий. Глицерол-фосфат архей тоже отличается от бактериального — у архей используется другой его оптический изомер."
                http://users.livejournal.com/_hellmaus_/120714.html
                Ответить
                • niki > RomTV | 20.09.2014 | 00:11 Ответить
                  И прекрасно. Нет ведь никакого запрета на хиральность. Это же просто правое и левое. Причем где правое, а где левое чистая договоренность. Основные механизмы у всего живого одинаковы, а вспопогательные могут быть любыми. Это не только хиральности касается, а чего угодно. Есть общая основа, которая у всех одна (или почти одна, отдельные детали могут отличаться) и есть к ней дополнения. Этих дополнений миллион, чуть ли не каждый вид может свои изобретать.
                  Ответить
  • aa  | 15.07.2015 | 14:33 Ответить
    Интересно было бы провести эксперименты, когда через газовую фазу посылаются не только поляризованные электроны, но "электронные вихри", на подобии оптических вихрей. Т. е., когда орбитальный момент свободного электрона равен - h, 2h, ... Если эффект обнаружиться и в этом случае, то как я понимаю, для современной квантовой теории это будет большой проблемой.
    Ответить
Написать комментарий
Элементы

© 2005–2025 «Элементы»