Элементы Элементы большой науки

Поставить закладку

Напишите нам

Карта сайта

Содержание
Энциклопедия
Новости науки
LHC
Библиотека
Видеотека
Книжный клуб
Задачи
Детские вопросы
Плакаты
Научный календарь
Фестиваль
Научные блоги
Наука и право
ЖОБ
Поиск в Рунете

Поиск

Подпишитесь на новости науки


 
(на Subscribe.ru)



Библиотека

 
В. Чуб
Растения-ГМО


А. Леонтьев
Чему можно научиться у геккона


П. Образцов
Солнечный свет из Калашниково


В. Сыщенко
Одиннадцать сюжетов о ядерной физике в медицине


О. Закутняя
«Радиоастрон» раскрывает лепестки


С. Кутателадзе
Идеи Канторовича и современность


А. Рубцов
10 фактов об открытии динамического эффекта Казимира


А. Ильин
«Фобос-Грунт» — гибель мечты


С. Попов
Как расширялась Вселенная в 2011 году


В. Курт
Куда летит Солнце?







Главная / Новости науки версия для печати

Крупным млекопитающим может грозить вымирание из-за накопления вредных мутаций


Три представителя крупных млекопитающих, данные по которым использованы в обсуждаемой работе. По массе тела они наиболее близки к среднему значению для этой группы (369,5 кг). Сверху вниз: сивуч (Eumetopias jubatus) — часть лежбища, занятого самцом и гаремом самок; фото с сайта www.enature.com, © Michael H. Francis; як (Bos grunniens), фото с сайта www.cwca.org.cn; дюгонь (Dugong dugon), фото с сайта savci.upol.cz, © Duane Yates 1999
Три представителя крупных млекопитающих, данные по которым использованы в обсуждаемой работе. По массе тела они наиболее близки к среднему значению для этой группы (369,5 кг). Сверху вниз: сивуч (Eumetopias jubatus) — часть лежбища, занятого самцом и гаремом самок; фото с сайта www.enature.com, © Michael H. Francis; як (Bos grunniens), фото с сайта www.cwca.org.cn; дюгонь (Dugong dugon), фото с сайта savci.upol.cz, © Duane Yates 1999

Слабые мутации, оказывающие только незначительное воздействие на организм, тем не менее могут накапливаться в популяции и даже привести к её вымиранию, если мутации вредные. Вероятность такого хода событий существенно выше в небольших популяциях, содержащих малое число особей. А поскольку у млекопитающих численность популяции и масса тела связаны обратной зависимостью (чем крупнее животные, тем они малочисленнее), крупные виды должны накапливать мутации быстрее, чем мелкие. Это теоретическое предположение в настоящее время подтверждено российскими исследователями, проанализировавшими данные по геномам 110 видов млекопитающих разного размера. Выяснилось, что накопление «слабовредных» мутаций в кодирующих белки митохондриальных генах идет существенно быстрее у крупных видов, чем у мелких. А отсюда очевидно, что прослеживаемая в эволюции многих групп животных тенденция к увеличению размеров тела на самом деле может быть ограничена генетическими факторами.

У любых организмов время от времени возникают ошибки генетического кода — мутации. Если эти мутации слабые (нейтральные и оказывающие незначительное отрицательное либо положительное воздействие), то они могут накапливаться в популяции. Теоретически следует ожидать, что такое накопление возможно только в небольших популяциях, где в силу случайного стечения обстоятельств и генетического дрейфа (например, при прохождении через «бутылочное горлышко» малой численности) слабые мутации могут «закрепиться», то есть начать обнаруживаться у всех особей. В больших же популяциях, насчитывающих множество особей, всегда достаточно эффективно действует так называемый «очищающий отбор», удаляющий всякие отклонения от нормы.

Попытку проверить эту идею на реальных данных по составу генома разных видов млекопитающих недавно предприняли Константин Попадьин, Леонард Полищук (оба с биологического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова), Лейла Мамирова (Институт проблем передач информации РАН), Дмитрий Кнорре (Институт физико-химической биологии им. А. Н. Белозерского при МГУ) и Константин Гунбин (Институт цитологии и генетики СО РАН). Авторы исходили из того, что для млекопитающих уже давно хорошо известна четкая отрицательная зависимость между массой тела взрослого животного и их численностью в природе: чем крупнее животные, тем ниже плотность их популяций. Соответственно, массу тела можно было использовать как показатель численности популяций.

Три представителя мелких млекопитающих, данные по которым использованы в обсуждаемой работе. По массе тела они наиболее близки к среднему значению для этой группы (275 г). Вверху слева: тафа, или австралийская сумчатая крыса (Phascogale tapoatafa), фото с сайта www.ernmphotography.com, © ERN MAINKA; вверху справа: обыкновенная серая крыса (Rattus norvegicus), фото с сайта www.biopix.eu, © Biopix.dk: JC Schou. Внизу: буролицый опоссум (Metachirus nudicaudatus), фото с сайта www.terrambiente.org, © Smithsonian Institution
Три представителя мелких млекопитающих, данные по которым использованы в обсуждаемой работе. По массе тела они наиболее близки к среднему значению для этой группы (275 г). Вверху слева: тафа, или австралийская сумчатая крыса (Phascogale tapoatafa), фото с сайта www.ernmphotography.com, © ERN MAINKA; вверху справа: обыкновенная серая крыса (Rattus norvegicus), фото с сайта www.biopix.eu, © Biopix.dk: JC Schou. Внизу: буролицый опоссум (Metachirus nudicaudatus), фото с сайта www.terrambiente.org, © Smithsonian Institution

Оценить темп накопления «слабовредных» мутаций можно было только построив по молекулярно-генетическим данным небольшие филогенетические деревья, ведущие к современным видам. Исходный материал — это результаты секвенирования митохондриального генома разных видов млекопитающих, сведенные в базу данных, которая поддерживается Национальным центром биотехнологической информации США (National Center for Biotechnology Information). Из 138 видов млекопитающих, для которых известны нуклеотидные последовательности для всех 13 белок-кодирующих генов митохондриального генома, в работе использованы данные по 110 видам.

На основании этих материалов были восстановлены последовательности аминокислот в белках современных видов, а специальная компьютерная программа построила филогенетические деревья, устанавливая генотип их предполагаемых предков. После этого можно было посмотреть, какие изменения произошли в последовательностях нуклеотидов (кодонах), кодирующих ту или иную аминокислоту. Поскольку генетический код избыточен, одну и ту же аминокислоту могут кодировать разные кодоны. Некоторые мутации являются нейтральными: кодон меняется, а аминокислота синтезируется та же. Это так называемое синонимичное замещение. В случае «слабовредной» мутации начинает синтезироваться другая аминокислота. Это так называемое несинонимичное замещение.

Накопление слабовредных мутаций (по величине отношения несинонимичных замен к синонимичным) у крупных (large) млекопитающих происходит более интенсивно, чем у мелких (small). Маленький квадратик — это средняя величина для каждой группы (по 55 видов в каждой группе). Большие прямоугольники вокруг — пределы, задаваемые одним стандартным отклонением (±1 SE), «усы» — доверительные интервалы на уровне 0,95 (рис. из обсуждаемой статьи в PNAS)
Накопление слабовредных мутаций (по величине отношения несинонимичных замен к синонимичным) у крупных (large) млекопитающих происходит более интенсивно, чем у мелких (small). Маленький квадратик — это средняя величина для каждой группы (по 55 видов в каждой группе). Большие прямоугольники вокруг — пределы, задаваемые одним стандартным отклонением (±1 SE), «усы» — доверительные интервалы на уровне 0,95 (рис. из обсуждаемой статьи в PNAS)

Опираясь на имеющиеся данные, авторы обсуждаемой работы определяли для всех современных видов (кончиков веток филогенетического древа) отношение несинонимичных замен к синонимичным. Затем всю совокупность из 110 видов млекопитающих ранжировали по массе тела взрослых особей и разделили на две группы (по 55 видов) — крупных и мелких. Средний вес группы крупных млекопитающих оказался равным 359,5 кг, а средний вес мелких значительно меньше — 275 г. Сравнение этих двух групп показало, что скорость накопления несинонимичных замен относительно синонимичных у крупных видов существенно (на 43%) выше, чем у мелких. Помимо этого показателя авторы использовали еще несколько молекулярно-генетических свидетельств наличия слабых вредных мутаций и почти во всех случаях скорость их накопления была выше у крупных млекопитающих, чем у мелких.

Выявленный эффект интересно рассмотреть в общем эволюционном контексте. Дело в том, что в эволюции нескольких групп наземных позвоночных, в том числе млекопитающих, прослеживается четкая тенденция увеличения размера тела. Крупный размер снижает риск стать жертвой хищника (на носорогов и слонов мало кто рискнет напасть), а кроме того, с увеличением размера уменьшаются удельные траты на обмен. Однако плюсам, связанным с крупным размером тела, противостоят серьезные минусы. Популяции крупных животных не могут быть многочисленными, они характеризуются обычно невысокой плотностью, а уменьшение численности всегда чревато угрозой вымирания — в результате действия как экологических факторов, так и генетических (накопления вредных мутаций). Последнее утверждение в настоящее время можно считать доказанным.

Различные молекулярно-генетические показатели, свидетельствующие о накоплении «слабовредных» мутаций (в том числе A — отношение несинонимичных нуклеотидных замен к синонимичным) в зависимости от веса тела (логарифмическая шкала) для 110 видов млекопитающих. Разброс данных весьма велик, но достоверная тенденция большей интенсивности накопления с увеличением размера тела очевидна. Рис. из обсуждаемой статьи в PNAS
Различные молекулярно-генетические показатели, свидетельствующие о накоплении «слабовредных» мутаций (в том числе A — отношение несинонимичных нуклеотидных замен к синонимичным) в зависимости от веса тела (логарифмическая шкала) для 110 видов млекопитающих. Разброс данных весьма велик, но достоверная тенденция большей интенсивности накопления с увеличением размера тела очевидна. Рис. из обсуждаемой статьи в PNAS

Источник: Konstantin Popadin, Leonard V. Polishchuk, Leila Mamirova, Dmitry Knorre, Konstantin Gunbin. Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals // PNAS. 2007. V. 104. P. 13390–13395.

Cм. также:
1) Leila Mamirova, Konstantin Popadin, Mikhail S. Gelfand. Purifying selection in mitochondria, free-living and obligate intracellular proteobacteria (Pdf, 1,3 Мб) // BMC Evolutionary Biology. 2007. V. 7. P. 17. doi:10.1186/1471-2148-7-17 (статья в открытом доступе).
2) Alissa M. Resch, Liran Carmel, Leonardo Mariño-Ramírez, Aleksey Y. Ogurtsov, Svetlana A. Shabalina, Igor B. Rogozin, Eugene V. Koonin. Widespread positive selection in synonymous sites of mammalian genes // Molecular Biology and Evolution. 2007. V. 24 P. 1821–1831 (статья в открытом доступе).
3) J. Damuth. Interspecific allometry of population density in mammals and other animals: the independence of body mass and population energy-use // Biol. J. Linn. Soc. 1987. V. 31. P. 193–246.
4) У фитопланктона соотношение размера и численности то же, что и у млекопитающих, «Элементы», 31.10.2006.

Алексей Гиляров

Последние новости: Генетика, Экология, Наука в России, Алексей Гиляров

22 мая
Ген, улучшающий память, заодно повышает и риск посттравматического стрессового растройства
15 мая
Обилие редких мутаций в генофонде человечества существенно превышает современные оценки
7 мая
Дафнии заселяют альпийские озера, ставшие более продуктивными
26 апреля
Сегменты у насекомых развиваются по часам
25 апреля
Злокачественные опухоли и их метастазы не только растут, но и активно изменяются независимо друг от друга
24 апреля
Личинки губок видят нетрадиционным способом
20 апреля
Глобальное потепление после последнего оледенения сопровождалось опережающим повышением содержания СО2 в атмосфере
18 апреля
Дрожжи занимаются сексом не от хорошей жизни
17 апреля
От паразита можно защититься, но иногда выгоднее ему поддаться
12 апреля
В субтропическом лесу близкородственные деревья растут вдали друг от друга


Астрономические наблюдения недели

Новости науки почтой (рассылка на Subscribe.ru):

 

Новости науки по темам: антропология, археология, астрономическая научная картинка дня, астрономия, биология, биотехнологии, генетика, геология, затмения, информационные технологии, космос, лингвистика, математика, медицина, нанотехнологии, наука в России, наука и общество, Нобелевские премии, палеонтология, Первое апреля, психология, технологии, физика, химия, эволюция, экология, энергетика, этология

Новости науки по авторам: Дарья Баранова, Вера Башмакова, Александр Бердичевский, Максим Борисов, Варвара Веденина, Александр Венедюхин, Михаил Волович, Алексей Гиляров, Сергей Глаголев, Николай Горностаев, Юрий Ерин, Анастасия Еськова, Дмитрий Замолодчиков, Игорь Иванов, Мария Кирсанова, Дмитрий Кирюхин, Александр Козловский, Алексей Левин, Андрей Логинов, Лейла Мамирова, Александр Марков, Мария Медникова, Вадим Мокиевский, Максим Нагорных, Елена Наймарк, Петр Петров, Александр Пиперски, Константин Попадьин, Сергей Попов, Роман Ракитов, Татьяна Романовская, Александр Самардак, Александр Сергеев, Андрей Сидоренко, Даниил Смирнов, Любовь Стрельникова, Алексей Тимошенко, Мария Шнырёва

Новости науки по месяцам: 2012 V, IV, III, II, I  2011 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2010 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2009 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2008 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2007 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2006 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I  2005 XII, XI, X, IX, VIII, VII, VI, V, IV, III, II, I 


Научные новости у наших партнеров: «Биомолекула», «В мире науки», «Вокруг света», Газета.ру, Грани.ру, Лента.ру, «Наука и жизнь», «Популярная механика», Gzt.ru

 


при поддержке фонда Дмитрия Зимина - Династия