Международная молодежная школа «Вычислительная филоинформатика» (Computational Phyloinformatics 2012)
Ближайшие события
6–17 августа 2012 года, Москва, Шуваловский учебный корпус Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова.
Организаторы:
МГУ им. М. В. Ломоносова,
Институт проблем передачи информации им. А. А. Харкевича РАН (ИППИ РАН),
National Evolutionary Synthesis Center (NESCent),
The Phyloinformatics Research Foundation.
Участники:
студенты старших курсов, аспиранты и молодые специалисты, которым требуется владение инструментами программирования и специализированными программными пакетами (включая Perl, Ruby, SQL) для практической работы в области молекулярной филогенетики и функциональной геномики.
Школа представляет собой интенсивный двухнедельный курс обучения теоретическим основам и практическим навыкам работы с современными средствами анализа молекулярных данных.
Программа школы состоит из четырех блоков:
- Блок I: Введение в язык Perl, включая объектно-ориентированное программирование и создание пакетов.
- Блок II: Введение в практику BioPerl и Bio::Phylo, включая создание скриптов для массового построения филогенетических деревьев, автоматизированной верификации эволюционных моделей, сборки супердеревьев, калибровки длин ветвей деревьев и др.
- Блок III: Введение в практику языка BioRuby в применении к задачам молекулярной эволюции и функциональной геномики, включая реконструкцию событий эволюции генов, автоматизацию построения множественного выравнивания, реконструкцию филогенетических деревьев и др.
- Блок IV: Введение в создание баз данных; вычисление и запрашивание вложенных множеств и транзитивное замыкание; запрашивание топологий больших деревьев (на примере репозитория GenBank, NCBI) и больших наборов деревьев (на примере базы TreeBASE).
Рабочий язык школы: английский.
Крайний срок представления заявок на участие: 15 мая 2012 г.
По окончании школы участники получат сертификат квалификации
Зачисление в школу осуществляется на конкурсной основе.
Контакты:
тел.: (495) 939-14-40, (495) 939-71-85;
факс: (495) 939-31-81;
E-mail: rusin@iitp.ru.
