Согласно традиционным взглядам, разные виды организмов сосуществуют, если различаются их экологические ниши. Согласно новой гипотезе нейтральности — если они сходны по своим демографическим характеристикам и занимают одну нишу. Предложенная недавно простая модель экологических сообществ позволяет примирить эти, казалось бы, несовместимые гипотезы.

Достигнутое на ранних этапах эволюции совершенство, позволяющее бактериям существовать без радикальных изменений, вовсе не означает, что они не подвержены естественному отбору и не способны быстро эволюционировать в ответ на изменения окружающей среды. А окружающая среда для бактерий — это не только совокупность физико-химических условий, но и другие бактерии.

За счет деятельности азотфиксирующих бактерий в океан из атмосферы попадает около 140 млн тонн азота в год и столько же возвращается в атмосферу в результате восстановления нитратов другими бактериями. Считалось, что азотфиксация и денитрификация пространственно разобщены. Но недавние исследования показали, что азот связывается поблизости от тех мест, где он теряется в ходе денитрификации.