Родился в 1955 году в Стокгольме (его отец, Суне Бергстрём, — лауреат Нобелевской премии по физиологии и медицине). В 1986 году получил степень PhD по молекулярной иммунологии в Уппсальском университете. Работал в Цюрихском университете, Калифорнийском университете в Беркли, Уппсальском, Мюнхенском университетах и других научных центрах и учебных заведениях. С 1997 года возглавляет отделение генетики Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка (Лейпциг, Германия).

Один из основателей палеогенетики. Рабочая группа Пэабо занимается исследованием генома неандертальца (в 2010 году в журнале Science были опубликованы предварительные результаты его полной расшифровки).

Обладатель множества научных наград (среди них есть и Большая золотая медаль РАН им. М. В. Ломоносова). Член Шведской королевской академии наук.

Страница Сванте Пэабо на сайте Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка
Страница в Википедии о Сванте Пэабо
Страница в английской Википедии о Сванте Пэабо