Восьмикластерная структура геномов хлоропластов наземных растений

М.Г. Садовский^1,2, М.Ю. Сенашова¹, А.В. Малышев¹

¹Институт вычислительного моделирования СО РАН
660036 Красноярск, Академгородок
e-mail: msad@icm.krasn.ru
²Сибирский Федеральный университет
Институт фундаментальной биологии и биотехнологии
660036 Красноярск, просп. Свободный, 79
Поступила в редакцию 03.04.2017 г.

В данной работе было проверено, является ли семикластерная структура, обнаруженная у бактерий, универсальной и наблюдаются ли все обнаруженные свойства такой структуры для других геномов. Исследована внутренняя структурированность геномов хлоропластов и цианобактерий, показано, что эта структурированность существенно отличается от ранее обнаруженной для бактериальных геномов. Под структурированностью понимается кластеризация частотных словарей триплетов отдельных фрагментов генома, определяемых регулярным порядком, вне зависимости от функциональной роли того или иного участка. Кластеризация проводилась методом упругих карт.

Полный текст статьи доступен на сайте Elibrary.ru (необходимо зарегистрироваться).