Информационная ценность различных триплетов некоторых генетических систем

М. А. Мамонова¹, М. Г. Садовский²

¹ Красноярский государственный университет,
660041 Красноярск, пр. Свободный, 79
² Институт биофизики СО РАН,
660036 Красноярск, Академгородок
e-mail: uvenal@ktk.ru, msad@icm.krasn.ru
Поступила в редакцию 03.02.2003 г.

Предложен новый метод выделения и описания в целостных нуклеотидных последовательностях слов (подпоследовательностей сравнительно малой длины), которые обладают высокой информационной ценностью. Информационная ценность определяется отклонением реальной частоты слова от ожидаемой. Исследовано распределение таких слов длины 3 среди геномов таксономически близких друг другу организмов (аденовирусов). Показано, что некоторые триплеты, обладающие высокой информационной значимостью, встречаются в семействе геномов вирусов с высокой частотой. Обсуждаются молекулярно-эволюционные аспекты формирования наборов универсальных информационно значимых сайтов (инвариантов) и уникальных сайтов.