Молекулярные маркеры и современная филогенетика млекопитающих

А. А. Банникова

Московский государственный университет им. М.В.
Ломоносова, биологический факультет,
кафедра зоологии позвоночных
119992 Москва, Ленинские горы
e-mail: grechko@genome.eimb.relarn.ru
Поступила в редакцию 23.06.2003 г.

Памяти Б.М. Медникова
В обзоре разбираются основные молекулярные маркеры, используемые в филогенетических реконструкциях млекопитающих, - митохондриальные и ядерные гены, сателлитная ДНК, короткие и длинные ретропозоны. Рассмотрены проблемы филогенетических реконструкций по генным последовательностям - выбор гена и внешней группы, сдвиг нуклеотидного и аминокислотного состава, эффект притяжения длинных ветвей, размер выборки и длина последовательности. Значительная часть обзора посвящена разбору методов мультилокусного анализа ДНК (RAPD, RFLP, IS-PCR, ISSR-PCR, AFLP). Обсуждаются их достоинства и недостатки, приводятся примеры удачного и неудачного применения на разных таксономических уровнях. Обсуждены возможные причины несоответствия молекулярно-филогенетических реконструкций между собой и морфологическим гипотезам. Кратко рассмотрены новейшие представления о макрофилогении плацентарных млекопитающих, основанные на молекулярно-генетических данных. Показана высокая надежность предложенных молекулярными филогенетиками гипотез о делении плацентарных на Afrothertia (включая Afrosoricida) и Laurasiatheria, монофилии клад Euarchontoglires и Cetratiodactyla. Сделан вывод, что тщательный анализ соответствий и противоречий между разными данными и поиск конгруэнтных заключений, сделанных по разным признакам, - это наиболее продуктивный путь развития филогенетики.