Лекция прочитана 26 марта 2019 года в Национальной лаборатории им. А. Алиханяна (Армения), в рамках 6-й Астрофизической школы «Траектория».
В лекции объясняется и демонстрируется технология секвенирования ДНК на оборудовании Oxford Nanopore; как образец используется ДНК бактериальных плазмидов E.Coli.
В начале дается теоретическое введение о технологии работы нанопорного секвенсора, основывающегося на интеграции биологических нанопор в твердотельную мембрану. После подготовки реагентов и образца ДНК Анна Корсакова проводит короткую сессию секвенирования, демонстрируя результат в виде полученного ДНК-кода, транслированного программой MinKNOW из сырых данных секвенсора. Эксперимент показывает, какие проблемы можно решить с помощью данного подхода (например, исследования антибиотической резистентности, обнаружение химических модификаций ДНК вследствие повреждений, и т.д.).
Из этой лекции вы узнаете о прикладных возможностях наноинженерии в молекулярной биологии и увидите, как неразрывно связаны физика, биология и химия протекающих при секвенировании процессов.
