В интернете появилась «Энциклопедия жизни»

Логотип «Энциклопедии жизни», появившейся в сети 26 февраля 2008 года. Изображение с сайта Лаборатории морской биологии в Вудс-Хоуле (www.mbl.edu) — организации, ответственной за техническую реализацию этого проекта
Логотип «Энциклопедии жизни», появившейся в сети 26 февраля 2008 года. Изображение с сайта Лаборатории морской биологии в Вудс-Хоуле — организации, ответственной за техническую реализацию этого проекта

26 февраля в интернет были выложены первые страницы «Энциклопедии жизни» — крупномасштабного проекта, вдохновленного выдающимся американским энтомологом и социобиологом Эдвардом Уилсоном. Согласно замыслу, новая интернет-энциклопедия должна включить в себя основные сведения обо всех известных науке видах живых организмов (которых насчитывается уже почти 2 млн). Предполагается, что энциклопедия будет непрерывно обновляться. Руководители проекта надеются, что сумеют привлечь для работы над энциклопедией тысячи квалифицированных специалистов и найти средства для ее дальнейшего развития. Если этот проект удастся осуществить в задуманном объеме, «Энциклопедия жизни» станет главным сетевым источником информации о разнообразии жизни на Земле для биологов и для всех, кто в этой информации заинтересован. Доступ к энциклопедии будет полностью открытым.

Разнообразие живой природы изучает особая отрасль биологии — биологическая систематика, основы которой заложил в XVIII веке Карл Линней. Знания о видах живых организмов, населяющих нашу планету, росли со времен Линнея как снежный ком. В настоящее время науке известно почти два миллиона видов живых организмов. Но при этом ни один ученый со времен Линнея и ни одна книга со времен публикации его фундаментального труда «Система природы» («Systema naturae») уже не могли претендовать на обладание всей полнотой сведений о видах, известных науке. Каждый специалист-систематик хорошо знает лишь представителей одной или нескольких групп организмов, которыми он занимается профессионально, и не имеет ни малейшего представления о подавляющем большинстве видов, известных науке в целом.

Слева: Карл Линней — основатель современной биологической систематики. Портрет работы Александра Рослина с сайта en.wikipedia.org. Справа: титульный лист 1-го тома двухтомного 10-го издания книги Линнея «Система природы». Эта книга (по возможности) обобщала всё, что было известно науке на тот момент о разнообразии жизни на Земле. На такую всеохватность не претендовал с тех пор ни один труд по биологической систематике. Если сетевая «Энциклопедия жизни» будет осуществлена в задуманном объеме, все сведения о разнообразии живой природы вновь окажутся собраны в одном справочном пособии, объем которого будет превосходить объем «Системы природы» в тысячи раз. Иллюстрация с сайта static.zsl.org
Слева: Карл Линней — основатель современной биологической систематики. Портрет работы Александра Рослина с сайта en.wikipedia.org. Справа: титульный лист 1-го тома двухтомного 10-го издания книги Линнея «Система природы». Эта книга (по возможности) обобщала всё, что было известно науке на тот момент о разнообразии жизни на Земле. На такую всеохватность не претендовал с тех пор ни один труд по биологической систематике. Если сетевая «Энциклопедия жизни» будет осуществлена в задуманном объеме, все сведения о разнообразии живой природы вновь окажутся собраны в одном справочном пособии, объем которого будет превосходить объем «Системы природы» в тысячи раз. Иллюстрация с сайта static.zsl.org

Время от времени систематики публикуют обобщающие труды (каталоги той или иной группы), часто касающиеся лишь видов, распространенных только в некоторой области биосферы, например в Палеарктике — северной части Старого Света, включающей Европу, часть Африки к северу от Сахары и всю Азию, кроме территорий, расположенных к югу от Гималаев. Такие каталоги играют огромную роль в изучении разнообразия жизни, но неизбежно устаревают по мере того, как систематики описывают новые виды и лучше разбираются в системе тех видов, что уже описаны. В итоге, когда мы говорим, что тот или иной вид известен науке, мы подразумеваем лишь, что этот вид был некогда описан в соответствии с правилами, принятыми в биологической систематике, и известен специалистам, разбирающимся в систематике той группы, к которой данный вид относится.

Эдвард Уилсон (Edward O. Wilson), энтомолог и социобиолог из Гарварда (фото с обложки его автобиографии). Проект «Энциклопедия жизни» реализует замысел Уилсона, сформулированный им в одноименной статье 2003 года. Изображение с сайта www.xerces.org
Эдвард Уилсон (Edward O. Wilson), энтомолог и социобиолог из Гарварда (фото с обложки его автобиографии). Проект «Энциклопедия жизни» реализует замысел Уилсона, сформулированный им в одноименной статье 2003 года. Изображение с сайта www.xerces.org

Проект новой сетевой энциклопедии открытого доступа позволяет надеяться, что со временем накопленная за столетия существования биологической систематики информация обо всех известных науке видах живых организмов станет общедоступной. Ресурс, поставивший перед собой такую цель, получил название «Энциклопедия жизни» («Encyclopedia of Life»). Страницы энциклопедии впервые появились в сети в конце февраля 2008 года — меньше чем через год после того, как известный американский биолог Эдвард Уилсон (Edward O. Wilson), выступая на ежегодной популярной конференции TED (Technology Entertainment Design) в Калифорнии, призвал общественность помочь осуществлению этого проекта, и тем положил начало его осуществлению. Основные принципы, лежащие в основе проекта, были сформулированы Уилсоном в статье, опубликованной в 2003 году в журнале Trends in Ecology and Evolution.

В настоящее время над «Энциклопедией жизни» работают специалисты из ряда научных учреждений США, но в дальнейшем планируется привлечь биологов-систематиков со всего мира. Техническую часть — разработку и совершенствование сайта энциклопедии — взяла на себя биоинформатическая группа (Bioinformatics Group) старейшей американской биологической станции — Лаборатории морской биологии (Marine Biological Laboratory) в Вудс-Хоуле (Woods Hole), штат Массачусетс.

Пока в интернете появилась лишь ничтожная часть той информации, которую планируется собрать в «Энциклопедии жизни»: главная страница, несколько страниц с общими сведениями о проекте (в том числе ответы на часто задаваемые вопросы) и 25 образцовых страниц (exemplar pages), посвященных отдельным видам. Образцовые страницы показывают, в какой форме информация будет представлена в энциклопедии. Предполагается, что страница о каждом виде будет включать сведения о его систематическом положении, о синонимах к его валидному (то есть действующему) научному названию, об экологических особенностях данного вида, о его распространении, о степени угрозы его существованию и, по возможности, о многом другом.

Такие крупномасштабные проекты, как «Энциклопедия жизни», неизбежно сталкиваются с серьезными проблемами. Одна из них, технического характера, не заставила себя долго ждать: в первый же день онлайновой жизни энциклопедии сервер не справился с нагрузкой, вызванной миллионами обращений от пользователей со всего света, и некоторое время сайт энциклопедии был недоступен. К сожалению, это произошло именно тогда, когда специалисты, работающие над проектом, готовились представить энциклопедию на той самой конференции (TED), где весной прошлого года прозвучал призыв Уилсона, положивший начало «Энциклопедии жизни». Эту проблему вскоре удалось решить, но перед проектом стоят и другие, более сложные проблемы. Удастся ли привлечь к нему усилия специалистов, достаточные для того, чтобы содержание энциклопедии имело научную ценность и отражало последние достижения науки? Хватит ли средств, чтобы «Энциклопедия жизни» продолжала существовать и развиваться? Время покажет.

Выложенные в интернет образцовые страницы были встречены критикой ряда биологов — см., например, запись в блоге профессора Родерика Пейджа (Roderic Page) из Университета Глазго. Такая реакция вполне естественна. Едва ли «Энциклопедия жизни» сможет когда-нибудь удовлетворить всех биологов-систематиков без исключения (многие из них что-то в этом проекте предпочли бы организовать по-другому), но хотелось бы надеяться, что руководители проекта будут прислушиваться к конструктивной критике и совершенствовать и содержание, и форму новорожденной энциклопедии.

Не вызывает сомнения, что создание «Энциклопедия жизни» было во многом вдохновлено успехом Википедии. Так, согласно результатам исследований, проведенных несколько лет назад по инициативе журнала Nature, оказалось, что Википедия, которая по объему и скорости обновления информации превосходит любую когда-либо существовавшую энциклопедию, по достоверности содержащихся в ней сведений не сильно уступает даже наиболее авторитетной из всех энциклопедий мира — Британской («Encyclopaedia Britannica»), которая, в отличие от Википедии, не представлена полностью в интернете в открытом доступе. Это достижение Википедии оказалось неожиданным, потому что для Британники статьи пишут эксперты, а для Википедии, как будто, все кому не лень. Однако, по-видимому, общие усилия многих «кому не лень» (среди которых, разумеется, есть и немало экспертов) дают результат вполне сравнимый по качеству с результатом усилий отдельных экспертов.

Пример образцовой страницы (exemplar page) «Энциклопедии жизни»: статья об американском жуке-могильщике Nicrophorus americanus. Сверхзадача энциклопедии — сделать подобные страницы для каждого известного науке современного вида, а их насчитывается уже около 1,8 млн, причем, по-видимому, не меньшее число видов (в основном организмов небольшого размера, в частности насекомых) биологам еще предстоит описать. В дальнейшем планируется включить в энциклопедию и информацию о вымерших видах, известных по ископаемым остаткам. Скриншот с сайта www.eol.org
Пример образцовой страницы (exemplar page) «Энциклопедии жизни»: статья об американском жуке-могильщике Nicrophorus americanus. Сверхзадача энциклопедии — сделать подобные страницы для каждого известного науке современного вида, а их насчитывается уже около 1,8 млн, причем, по-видимому, не меньшее число видов (в основном организмов небольшого размера, в частности насекомых) биологам еще предстоит описать. В дальнейшем планируется включить в энциклопедию и информацию о вымерших видах, известных по ископаемым остаткам. Скриншот с сайта www.eol.org

Перед «Энциклопедией жизни» стоит сложная задача: с одной стороны, необходимо привлечь к работе над ней многих авторов, но с другой, учитывая претензию на научное значение накапливаемой информации, авторами должны стать лишь специалисты в соответствующих областях биологии. По крайней мере, каждая статья должна быть отредактирована грамотным специалистом (сбор первичной информации может осуществлять и непрофессионал; кроме того, этот процесс планируется частично автоматизировать, доверив поиск и накопление сведений, которые уже имеются в сети, специальным программам). Для решения этой задачи предполагается закрепить за специалистами, которые внесут свой вклад в этот проект, частичные авторские права, чтобы сохранить за каждым из авторов честь написания и редактирования страниц энциклопедии и чтобы каждый мог отразить свою работу над «Энциклопедией жизни» в личном резюме. Такая мера должна стимулировать специалистов к участию в проекте, но организаторам нужно выработать некоторую оптимальную стратегию, которая позволит учитывать вклад каждого участника не только в написание статей, но и (что не менее важно) в их редактирование.

Если «Энциклопедия жизни» сможет, подобно Википедии, взять достаточный разгон, чтобы обрести продолжительную жизнь в интернете, и, кроме того, вырастет в основное справочное пособие по биологическому разнообразию, она станет важнейшим достижением биологической систематики со времен трудов Линнея и позволит качественно улучшить представления человечества о многообразии живых организмов, населяющих нашу планету. Успешное осуществление этого проекта поможет не только научной работе, но и усилиям, направленным на сохранение исчезающих видов — нашего наследия, от которого мы с упорством, достойным лучшего применения, продолжаем ускоренными темпами избавляться.

Источник: Encyclopedia of Life.

Cм. также:
1) Emma Marris. First chapter of book of life goes live // Nature. 28 February 2008. V. 451. P. 1038.
2) Выступление Э. Уилсона в марте 2007 года с призывом профинансировать «Энциклопедию жизни» (видеоролик).
3) Edward O. Wilson. The Encyclopedia of Life // Trends in Ecology and Evolution. 2003. V. 18. P. 77–80.

Петр Петров


10
Показать комментарии (10)
Свернуть комментарии (10)

  • starbax  | 05.03.2008 | 12:24 Ответить
    Потрясающее начинание, жаль только что она на английском, но это имеет свои плюсы. Не нужно тратить ресурсы на создание переводов или "паралельных проектов" по примеру русскоязычной википедии, в которой в пять раз меньше статей чем в англоязычной. Да и равноценными их назвать нельзя (википедии). Точно так же с учетом "титанического" труда по описанию 1.8млн видов живых организмов, взять и перевести его хотя бы на 4 основных языка очень сложно. Это я к тому, что сейчас все очевидней становиться необходимость в изучении английского языка. В этом случае возможно создание мировых информ. баз подобных этой, без отвлечения на разные неполные "языковые проекты".
    Ответить
    • Math > starbax | 05.03.2008 | 12:56 Ответить
      Попробуйте переводчик:
      http://translate.google.com/translate?u=www.eol.org%2F&langpair=en%7Cru&hl=en&ie=UTF8
      Ответить
      • starbax > Math | 06.03.2008 | 09:26 Ответить
        Спасибо, но я не о себе. Я говорил к тому что пусть лучше будет один богатейший и качественнейший ресурс, пусть и на английском (к созданию которого, я надеюсь, и наши ученые приложат силы), чем куча неполных, разноязыковых ресурсов. Мало того что информации становиться все больше и больше, так мы еще её и на разные языки разделяем.
        Ответить
        • TestPilot > starbax | 10.03.2008 | 08:50 Ответить
          Сравнил я статьи из Википедии и этой новой энциклопедии. Во первых, даже статьи которые референсные(25 штук) и featured в eol по сравнению с вики дают гораздо меньше информации о интересующем виде, в том числе базовой. Нет кросслинков на другие статьи. Полностью отсутствуют категории. То есть, читая статью о некой рыбе в вики, я сразу могу глянуть статьи о других рыбах Южной Америки. Если вид находится на грани уничтожения - посмотреть другие исчезающие виды из соответствующей категории. Но, самое главное, это конечно же информация в статье. Объемы несравним. В еол нет оглавления, явно за ненадобностью. В Википедии, если не хочется - можно тоже прочитать первый абзац, самые базовые сведения там есть и затем перейти к интересующему разделу кликом мыши по боксу с содержанием. Количество статей? В вике ~80 000(статьи описывающие виды/роды/семейства итд.). В еол ~30 000.

          Посмотрим конечно, что будет через год. Десятки миллионов вбухиваемые в проект eol не должны совсем бесследно испариться. Но в то, что eol будет "богатейшим и качественным" ресурсом пока верится с трудом. Задатков к этому вроде невидно, кроме объемов финансирования.

          P.S. И да, last but not least, для человека владеющего другими языками, помимо английского, вики иногда таки предоставляет возможность прочитать некое альтернативное описание искомого предмета. Что, изредка, бывает чертовски интересно. А вот тем, кто не говорит "по буржуйски", eol предоставить совсем нечего, кроме некого слабого стимула его таки выучить.
          Ответить
    • dims > starbax | 13.03.2008 | 11:19 Ответить
      Вообще-то, в идеале, не человек должен приспосабливаться к ресурсу, а ресурс к человеку. Ясно, что нужен труд для перевода. Ну, а сколько труда нужно, чтобы обучить английскому тысяч потенциальных пользователей? Или сколько труда нужно, чтобы собрать в один ресурс данные даже на английском?

      Я думаю, что в будущем информация на ресурсах будет храниться на универсальном компьютерном языке и представляться на любом человеческом языке по запросу пользователя.
      Ответить
      • starbax > dims | 13.03.2008 | 19:35 Ответить
        Английский все самостоятельно учат*)
        На английском уже собирают.

        универсальный машинный язык, способный самостоятельно переводиться и на китайский и на русский и на английский? Возможно ли это? По моему (хотя я могу ошибаться) это серьезный шаг на пути создания искусственного интелекта (универсальный понятийный язык кодировки).

        Касательно английского, могу только пересказать один известный момент, что английский сейчас претендует на роль мирового языка и небезосновательно. А то что его нужно учить, так только для того чтобы все мировое научное сообщество могло работать сообща без языковых барьеров.
        Ответить
  • Алексей Гиляров  | 06.03.2008 | 10:22 Ответить
    Зашел на страничку, посвященную треске Gadus morhua. Ну и что? Пока информация крайне скудная. В общем коротеньком тексте про "биологию" трески есть несколько ссылок. Например, меня заинтересовала фраза: The populations around Greenland and Newfoundland have declined dramatically (Ref. 35388). (Численность популяций, обитающих в окрестностях Гренландии и Ньюфаундленда, сократилась катастрофически - ссылка 35388). Но линка на ссылку нет. Раздел же, который называется "Ссылки и дополнительная информация" (References and More Information), также никак не выделяется и гиперссылки в данном случае нет. Поэтому как найти статью номер 35388 - неясно. Наверное, потрудившись еще, прочитав дополнительные инструкции и потыкав по разным баннерам, в конце концов и найдешь, но сразу это не получилось :-( ! А еще очень жаль, что нет здесь же какого-то более или менее популярного текста про треску, про промысел, про численность популяций, про кормовые миграции... Ведь про треску то известно очень много! Лет 10 назад на обложке одного их номеров Nature была фотография - мужик в фартуке держит на руках огромную треску! И в том же номере маленькая заметка про то, что такая крупная треска сейчас ловится очень редко, и большая статья про промысел трески и последствия его для состояния популяции...
    Раздел Evolution and Systematics тоже никак не высвечивается (нет пока гиперссылки, хотя она, видимо, задумана). Короче пока, громко аплодировать и кричать "браво!!!!" еще рано. Остаетя только пожелать разработчикам терпения и удачи! Что касается переводов на русский, то это дохлый номер. Проще всему населению страны выучить английский!
    Ответить
  • kbob  | 06.03.2008 | 10:49 Ответить
    Подскажите, как найти нанобактерии?
    А то человека, то кое как нашел.
    Ответить
    • Алексей Гиляров > kbob | 06.03.2008 | 19:57 Ответить
      Нанобактерии - это нечто не очень понятное. Само их существование строго говоря не доказано. Вполне приличная статья есть в Википедии:
      http://en.wikipedia.org/wiki/Nanobacterium
      Включать их "Энциклопедию жизни" еще рано - и без них там по крайней мере 2 миллиона видов!!!!
      Ответить
      • starbax > Алексей Гиляров | 07.03.2008 | 09:34 Ответить
        Разьве их существование не доказано? А вот считать их жизнью может и рано*)
        Ответить
Написать комментарий


Элементы

© 2005-2017 «Элементы»